才華橫溢的奧地利作曲家莫紮特1791年12月5日在維也納逝世，享年36歲。當年莫紮特患病後，維也納最好的兩名醫生對他進行了救治。他們試圖通過放血和冷敷的方式使莫紮特退燒，但療效並不理想。莫紮特死後，醫生並未對他的屍體進行解剖，這無疑為查明莫紮特的死因增添了難度。至今，對於他的死因還有很多說法。
第一種說法：莫紮特死於汗熱病。在莫紮特患病期間的一位醫生注意到莫紮特四肢腫脹，並據此得出了莫紮特死於汗熱病的結論。但後人認為這種觀點不足以服眾。
第二種說法：莫紮特被學生的丈夫所害。傳記記者羅克林茨和尼邁斯柴克根據莫紮特妻子的陳述，認為莫紮特是被毒死的。但是在他們還未公開發表自己的觀點時，關於莫紮特被害的謠言已經是鋪天蓋地，沸沸揚揚了。在1792年新年前夕，一家柏林報紙曾報道過： "因為莫紮特的屍體已經浮腫，人們就認為他是被毒死的。"其中，早期的嫌疑人是弗朗庇·霍夫德門，他是莫紮特一個學生的丈夫。在莫紮特葬禮那天，霍夫德門打了他的妻子，然後就自殺了。所以，許多人就猜測他的妻子可能懷有莫紮特的孩子。但是，沒有真正的證據能說明霍夫德門和莫紮特的死有直接聯係。
第三種說法：莫紮特死於旋毛蟲病。美國西雅圖華盛頓大學的醫學專家簡·赫希曼在最新一期美國《內科學文獻》雜誌上撰文指出，莫紮特很有可能死於旋毛蟲病，這種病是吃了生的或沒有煮熟的含有蠕蟲的豬肉而引起的。旋毛蟲病的症狀是四肢腫脹、發燒，並且身體發癢。在莫紮特生活的年代裏，嚴重的旋毛蟲病可以致命，而生前莫紮特也抱怨過說身上很癢。
第四種說法：莫紮特被安東尼奧·薩列裏所害。莫紮特是被他的競爭對手、宮廷作曲家安東尼奧·薩列裏所害這一說法曾一度流行。此說法聲稱：薩列裏出於妒忌，設計毒死了才華在他之上的莫紮特。而薩列裏生前曾對他的學生說，有關他毒死了莫紮特的說法是"愚蠢的"。
除上述說法外，關於莫紮特的死因還有砷中毒、意外死亡等。
莫紮特被安葬後，按照當時的風俗，他的墳墓又被掘開。另一具屍體占據了莫紮特的墓室，而莫紮特的遺骨則分散四處。鑒於這種狀況，任何有關莫紮特死因的說法都查無實據。至今，莫紮特的死因仍然是一個不解之謎。