亞曆山大圖書館在長達200多年的歲月裏，作為古代希臘文化的中心，對古代世界文化的保存與交流起到了重要作用。不幸的是，亞曆山大圖書館後來被人毀滅。那麽，這座聞名古代世界的巨大圖書館到底是怎麽毀滅的?對此，先人沒有給我們留下可靠的史料記載，致使這一問題成為千古難解之謎。於是，後人對之作了各種各樣的猜測與假設。
第一種說法：公元前47年，羅馬統帥愷撒率軍隊遠征埃及，當時，愷撒的軍隊企圖搶走亞曆山大圖書館的圖書。於是，亞曆山大裏亞城市的市民們放火燒毀了港口的船隻以阻止書籍外運，船上的大火蔓延到了整個市區和圖書館，使亞曆山大圖書館被毀了一部分。另據古代曆史學家狄奧·卡西烏斯的記載，公元前41年，羅馬統帥馬可·安東尼從小亞細亞的另一所有名的圖書館--帕加馬圖書館裏把大約20萬卷的圖書撥給了以貌美著稱的古埃及女王克婁巴特拉七世，以作為對愷撒軍隊破壞亞曆山大圖書館的補償。
第二種說法：公元元年以後，亞曆山大圖書館的影響已大大減弱，其中的藏書有一部分被搬運到羅馬去充實羅馬的圖書館。
第三種說法：古埃及女王克婁巴特拉七世為了取悅於愷撒，曾以亞曆山大圖書館的藏書為代價以換取小亞細亞西北部古城帕加馬的圖書館。
第四種說法：公元273年，羅馬皇帝奧列裏亞努斯再次占領埃及，他燒毀了亞曆山大圖書館的主館部分，分館部分則被保存到公元391年基督教主教狄奧菲魯斯以圖書在異教寺院為由，下令將其全部燒毀為止。還有部分殘卷可能在公元645年被穆斯林征服者奧馬爾及其軍隊焚毀。據有記載說，亞曆山大圖書館裏的紙莎草紙和羊皮紙的書卷曾被穆斯林士兵用以燒洗澡水。
毫無疑問，在好幾百年的時間內，亞曆山大圖書館是世界上的奇跡之一，它的毀滅是世界曆史上最大的文化浩劫之一。隨著亞曆山大圖書館的被毀滅，對古代世界的許多情況我們便不得而知了，許多問題便隻能靠推測了。